Ещё на стадии проектирования, учитывая природные особенности региона, были определены возможные риски для морских биологических ресурсов, связанные со строительством в береговой и прибрежных зонах. В проект заранее включили мониторинг химического состава воды и биотестирование для того, чтобы избежать негативного воздействия на морскую флору и фауну.
Для сохранения природного баланса предусмотрели и меры по восполнению популяции рыб семейства лососёвых.
Специалисты экспериментально — производственного рыбоводного завода в посёлке Паратунка искусственно вырастили молодь кеты (Oncorhynchus keta) — с точки зрения выживания и приспособления самого лучшего вида «красной рыбы». Мальков-годовиков из инкубаторов проверила госкомиссия. Каждая особь должна весить 1 грамм.
Кета, как и другие лососёвые анадромна — часть жизни она проводит в море, а нерестится во впадающих в него пресноводных артериях.
В сотрудничестве с военными строителями и учёными рыбоводы отправили в реку Паратунка 2 миллиона мальков. Их родителей выловили именно отсюда. Выпуск провели строго природному сроку взросления. Мальки подрастут в речке и уйдут в береговые океанские воды полуострова, чтобы потом вновь вернуться сюда для завершения жизненного цикла и продолжения рода.
В каждом государственном контракте предприятий Военно-строительного комплекса по созданию на Камчатке мест дислокации подлодок и обновлению причального фронта обязательно учтены экологические аспекты, включая и сохранение биоресурсов.
